中亞五國(guó)與中國(guó)新疆毗鄰，同處歐亞板塊的中心位置，地質(zhì)構(gòu)造相互銜接；同是遠(yuǎn)離海洋的內(nèi)陸區(qū)域，同屬典型的大陸性氣候，地理?xiàng)l件極為相似；自然資源都很豐富，地質(zhì)條件較為接近；且都是從游牧民族發(fā)展起來(lái)的，國(guó)民經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)比較相似，但都不夠合理；在科研和科技發(fā)展上，都屬于起步晚、底子薄，尤其在高科技領(lǐng)域，相對(duì)于其他地區(qū)而言嚴(yán)重滯后。但在富有地區(qū)特色的農(nóng)業(yè)、牧業(yè)、重工業(yè)等領(lǐng)域，通過(guò)雙方幾代科技人員堅(jiān)持不懈的努力，也取得了一些舉世矚目的成就。
　　新疆與中亞五國(guó)的合作互補(bǔ)性變化比較大，從初期的相互提供原材料到人無(wú)我有的初級(jí)產(chǎn)品，到現(xiàn)在的人有我亦有，但我方質(zhì)優(yōu)價(jià)更廉的產(chǎn)品。從起初的小規(guī)模、低檔次合作到后來(lái)的大規(guī)模、高科技合作，從基礎(chǔ)科學(xué)領(lǐng)域的合作到高新技術(shù)領(lǐng)域的合作(如生物工程等)。雙方貿(mào)易限制越來(lái)越少，經(jīng)過(guò)改革后雙方的外貿(mào)體制越來(lái)越完善，運(yùn)行機(jī)制越來(lái)越靈活，可實(shí)施操作的合作范圍越來(lái)越寬；雙方的合作風(fēng)險(xiǎn)有所降低，合作氣氛有明顯改善，合作逐漸趨向于規(guī)范的國(guó)際通行的合作方式，短期行為、非正常和非正規(guī)合作方式已逐漸行不通并開(kāi)始大量減少。雙方更注重合作的時(shí)效性，一般的禮節(jié)性互訪(fǎng)明顯減少，而擁有簽字權(quán)的人員的訪(fǎng)問(wèn)頻繁起來(lái)，雙方所簽合同的履約率越來(lái)越高，合作成本明顯降低。
　　中亞五國(guó)與中國(guó)新疆可以開(kāi)展互補(bǔ)性合作的領(lǐng)域很多，最重要的是工業(yè)類(lèi)、農(nóng)牧類(lèi)、資源類(lèi)、服務(wù)類(lèi)、生態(tài)類(lèi)、環(huán)保類(lèi)及高新技術(shù)領(lǐng)域的合作。
　　工業(yè)類(lèi)合作主要涉及農(nóng)機(jī)、電工電器、石化通用機(jī)械和基礎(chǔ)件在內(nèi)的機(jī)械工業(yè)和包括計(jì)算機(jī)軟件開(kāi)發(fā)與信息服務(wù)、衛(wèi)星地面接收設(shè)備、廣播電視設(shè)備、熱敏元件與傳感器在內(nèi)的電子工業(yè)；包括水電、火電、核電、風(fēng)電和氣電在內(nèi)的電力工業(yè)；包括建筑材料、非金屬礦和無(wú)機(jī)非金屬新材料在內(nèi)的建材工業(yè)；包括棉紡、毛紡、麻紡、絲織、棉針織、毛針織、印染、化纖等在內(nèi)的輕紡工業(yè)；包括家用電器、日化用品、小五金、小百貨、電訊及辦公用品等在內(nèi)的民用品工業(yè)；造紙業(yè)和塑料工業(yè)；包括腸衣業(yè)、乳品業(yè)、制糖業(yè)、煙業(yè)、漁業(yè)等在內(nèi)的食品工業(yè)。上述領(lǐng)域都是雙方還未開(kāi)展大規(guī)模合作、在技術(shù)設(shè)備和價(jià)格上都各有優(yōu)勢(shì)、極具合作潛力的部門(mén)。
　　農(nóng)牧類(lèi)合作主要包括棉花、糧食等對(duì)雙方都很重要的經(jīng)濟(jì)作物和糧食作物的品種資源搜集、良種引進(jìn)與選育、品種與種子審定、良種繁育與推廣、大規(guī)模機(jī)械化集約化種植、機(jī)械化植物保護(hù)以及節(jié)水灌溉、引水工程（如引額入克、入烏工程）和果蔬新品種引進(jìn)、大面積推廣及改進(jìn)畜群結(jié)構(gòu)、草場(chǎng)改良、家禽集約化大規(guī)模生產(chǎn)等方面。
　　資源類(lèi)合作主要涉及雙方地區(qū)發(fā)展最重要的支柱型產(chǎn)業(yè)能源類(lèi)、金屬類(lèi)和非金屬類(lèi)礦產(chǎn)的勘探、開(kāi)采和加工。其中能源類(lèi)包括石油、天然氣和煤炭等雙方儲(chǔ)量都很大的礦產(chǎn)勘探、開(kāi)采和加工；金屬類(lèi)包括黑色金屬、有色金屬、稀有金屬和貴金屬的勘探、開(kāi)采和加工；非金屬礦包括化工原料非金屬礦、建筑材料非金屬礦、特種非金屬礦和冶金輔助原料非金屬礦等的勘探、開(kāi)采和加工。由于雙方都是資源富集區(qū)，這一領(lǐng)域的合作將對(duì)雙方都有實(shí)效，對(duì)國(guó)民經(jīng)濟(jì)的發(fā)展產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響。
　　服務(wù)類(lèi)合作主要指交通運(yùn)輸、郵電通訊、醫(yī)藥衛(wèi)生、旅游產(chǎn)業(yè)、科技教育等方面的合作。其中交通運(yùn)輸包括鐵路、公路、航空和管道運(yùn)輸方面的合作。中亞五國(guó)與中國(guó)新疆的合作已開(kāi)展多年，但距雙方經(jīng)貿(mào)合作的需求還有很大距離，亟需繼續(xù)加強(qiáng)這方面的合作。郵電通訊主要包括電信業(yè)、廣播電視等方面的合作。雙方在傳統(tǒng)的郵政業(yè)合作多年，但在移動(dòng)通訊、電子郵件、有線(xiàn)電視等電信方面的合作還未展開(kāi)，雙方需要立即開(kāi)始這一領(lǐng)域的合作。在醫(yī)藥衛(wèi)生方面，中亞五國(guó)可與新疆在民族醫(yī)藥、中醫(yī)藥、醫(yī)療用品的生產(chǎn)與開(kāi)發(fā)及居民衛(wèi)生防疫與保健等領(lǐng)域開(kāi)展多方位的合作。在旅游方面，由于有著共同的舉世聞名的古“絲綢之路”、獨(dú)特的自然景觀(guān)和人文景觀(guān)，以及獨(dú)具風(fēng)情的民風(fēng)民俗，雙方可以合作的路線(xiàn)和方式較多，極具開(kāi)發(fā)潛力，雙方應(yīng)共同開(kāi)發(fā)這塊寶藏。在科教方面，可在中亞國(guó)家處于世界前沿的基礎(chǔ)研究領(lǐng)域的物理、化學(xué)、應(yīng)用數(shù)學(xué)、地理地質(zhì)學(xué)等方面和新疆較有優(yōu)勢(shì)的胚胎移植、良種繁育等應(yīng)用學(xué)科以及信息技術(shù)等高新技術(shù)領(lǐng)域開(kāi)展共同研究、開(kāi)發(fā)、教學(xué)等實(shí)質(zhì)性的合作。
　　生態(tài)類(lèi)合作主要涉及雙方動(dòng)植物資源的保護(hù)與研究、享譽(yù)世界的文物保護(hù)與研究、劃入世界自然保護(hù)區(qū)的生態(tài)保護(hù)與研究(如喀納斯河流域)、世界瀕危物種的保護(hù)和恢復(fù)與研究等(如賽加羚羊、普氏野馬)。
　　環(huán)保類(lèi)合作主要包括對(duì)雙方影響都很大的核廢料、工業(yè)廢料、取暖廢料等在內(nèi)的空氣污染、水污染、干旱、土地沙漠化和鹽漬化等的治理與研究。環(huán)境污染是一個(gè)世界性的問(wèn)題，不存在地域限制，尤其對(duì)鄰近國(guó)家和地區(qū)影響較大。中亞五國(guó)與中國(guó)新疆都面臨同樣的治理難題，雙方亟需加強(qiáng)這方面的合作。
　　高新技術(shù)合作主要包括與雙方有關(guān)的軟件開(kāi)發(fā)(如俄語(yǔ)翻譯系統(tǒng))、信息技術(shù)、自動(dòng)化控制、電信服務(wù)等方面。
　　上述領(lǐng)域是基于雙方特殊的地理位置所決定的，由于疆界毗鄰，在生態(tài)和環(huán)保方面雙方相互影響的地方非常多，也很直接，雙方只能與對(duì)方開(kāi)展合作。